Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms