Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJC1P36383 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJC1P36383 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms