Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms