Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD1P33897 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms