Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms