Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms