Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB2P29033 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms