Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms