Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms