Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms