Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP1P23763 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms