Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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