Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms