Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP4AP20648 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms