Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH1P12830 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms