Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms