Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms