Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.2 ms