Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms