Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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