Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGSM2O43147 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms