Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBDO15205 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBDO15205 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.8 ms