Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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