Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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USP17L12C9JPN9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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USP17L12C9JPN9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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USP17L12C9JPN9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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USP17L12C9JPN9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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