Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ERVV-2B6SEH9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ERVV-2B6SEH9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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