Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms