Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms