Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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