Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms