Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms