Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9Y3F1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms