Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNMA3Q9UL41 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms