Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF11Q9UIL8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF11Q9UIL8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms