Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms