Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNMT3BQ9UBC3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms