Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP35Q9P2H5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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