Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD5Q9P267 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD5Q9P267 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms