Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG3Q9NT62 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms