Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFGAP3Q9NP61 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms