Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms