Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms