Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms