Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms