Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms