Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM29Q9BSF4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms