Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NIPSNAP1Q9BPW8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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