Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGREF1Q99674 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGREF1Q99674 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGREF1Q99674 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGREF1Q99674 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms