Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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PKP4Q99569 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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