Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms