Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms